Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LRRC47Q8N1G4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRRC47Q8N1G4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRC47Q8N1G4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms