Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJD3Q8N144 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GJD3Q8N144 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD3Q8N144 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 997 ms