Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC170Q8IYT3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC170Q8IYT3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC170Q8IYT3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms