Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCN4BQ8IWT1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN4BQ8IWT1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCN4BQ8IWT1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms