Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC103Q8IW40 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC103Q8IW40 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms