Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX32Q86XE0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX32Q86XE0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms