Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMC6Q7Z403 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMC6Q7Z403 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms