Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA2D4Q7Z3S7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms