Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2R2Q712K3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2R2Q712K3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms