Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFX8Q6ZV50 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFX8Q6ZV50 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms