Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00336Q6ZUF6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00336Q6ZUF6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms