Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HACD2Q6Y1H2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HACD2Q6Y1H2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HACD2Q6Y1H2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms