Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYP26C1Q6V0L0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYP26C1Q6V0L0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms