Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1LQ6UX01 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1LQ6UX01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1LQ6UX01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1LQ6UX01 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1LQ6UX01 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1LQ6UX01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1LQ6UX01 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMBR1LQ6UX01 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMBR1LQ6UX01 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMBR1LQ6UX01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1LQ6UX01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms