Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHBDF2Q6PJF5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHBDF2Q6PJF5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDF2Q6PJF5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms