Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EMBQ6PCB8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EMBQ6PCB8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EMBQ6PCB8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms