Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNNM4Q6P4Q7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM4Q6P4Q7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM4Q6P4Q7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms