Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKRD54Q6NXT1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms