Protein–RNA interactions for Protein: Q6L9W6

B4GALNT3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT3Q6L9W6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
B4GALNT3Q6L9W6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
B4GALNT3Q6L9W6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4GALNT3Q6L9W6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4GALNT3Q6L9W6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
B4GALNT3Q6L9W6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms