Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC19Q6DKK2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTC19Q6DKK2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms