Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM200BQ69YZ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TMEM200BQ69YZ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TMEM200BQ69YZ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms