Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCNX4Q63HM2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX4Q63HM2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
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