Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK5

TSHZ3, Teashirt homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ3Q63HK5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TSHZ3Q63HK5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TSHZ3Q63HK5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TSHZ3Q63HK5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms