Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.9 ms