Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GGNBP1Q5YKI7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GGNBP1Q5YKI7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms