Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF9Q5VWM5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF9Q5VWM5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF9Q5VWM5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF9Q5VWM5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF9Q5VWM5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF9Q5VWM5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF9Q5VWM5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF9Q5VWM5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms