Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms