Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYDE2Q5VT97 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYDE2Q5VT97 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYDE2Q5VT97 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms