Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
OBSCNQ5VST9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
OBSCNQ5VST9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms