Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C12orf60Q5U649 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
C12orf60Q5U649 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C12orf60Q5U649 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms