Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CROCCQ5TZA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.8 ms