Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC9C2Q5TAH2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC9C2Q5TAH2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC9C2Q5TAH2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.6 ms