Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00242Q5T6M2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00242Q5T6M2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms