Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRAPPC3LQ5T215 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3LQ5T215 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms