Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM201Q5SNT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM201Q5SNT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms