Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPANXN3Q5MJ09 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPANXN3Q5MJ09 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms