Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF4

ZRANB3, DNA annealing helicase and endonuclease ZRANB3, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZRANB3Q5FWF4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZRANB3Q5FWF4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZRANB3Q5FWF4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZRANB3Q5FWF4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZRANB3Q5FWF4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZRANB3Q5FWF4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZRANB3Q5FWF4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZRANB3Q5FWF4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms