Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms