Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ACSM3Q53FZ2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACSM3Q53FZ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms