Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LSM12Q3MHD2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM12Q3MHD2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms