Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TYSND1Q2T9J0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TYSND1Q2T9J0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TYSND1Q2T9J0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TYSND1Q2T9J0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TYSND1Q2T9J0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TYSND1Q2T9J0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms