Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC96Q2M329 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC96Q2M329 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC96Q2M329 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC96Q2M329 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms