Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MSMPQ1L6U9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MSMPQ1L6U9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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