Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDR2Q16832 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DDR2Q16832 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDR2Q16832 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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