Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCSK7Q16549 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCSK7Q16549 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK7Q16549 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
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