Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SNAPC1Q16533 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SNAPC1Q16533 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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