Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC85BQ15834 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85BQ15834 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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