Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TCEA2Q15560 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCEA2Q15560 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCEA2Q15560 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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