Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KA1Q15418 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPS6KA1Q15418 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 739 ms