Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABEP1Q15276 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RABEP1Q15276 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RABEP1Q15276 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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