Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LAPTM4AQ15012 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAPTM4AQ15012 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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